Sistema hidrográfico de São José dos Pinhais

O sistema hidrográfico é representado por três bacias: Alto Iguaçu, Litorânea e Sudoeste. A figura diferencia as três bacias através de cores:

Cor azul: a Bacia do Alto Iguaçu é a maior bacia hidrográfica de São José dos Pinhais, e os afluentes neste município são os rios Avariu, Despique, Cotia, Pequeno, Itaqui, Miringuava, Miringuava-Mirim, Ressaca, e também a área de contribuição direta. Esta Bacia constitui a Bacia Hidrográfica do Iguaçu, que, em Foz do Iguaçu, deságua no Rio Paraná, afluente do Rio da Prata que caminha em direção ao Oceano Atlântico.
Cor lilás: a Bacia Litorânea é composta pelos rios Arraial, São João e Capivari 3. Esta bacia tem sua foz no oceano Atlântico.
Cor verde: a Bacia Sudoeste, composta pelo Rio da Várzea e Rio de Una, deságua na Bacia do Iguaçu.

Na tabela 1 segue uma breve descrição dos principais rios localizados no município (Dados SEMMA):

Rio Arraial	Limite dos município de São José dos Pinhais com Morretes e Guaratuba
Rio Capivari	Divisa de São José dos Pinhais com Tijucas do Sul
Rio Castelhanos	Localizado na Serra do Mar. Sua foz é no Rio São João
Rio Cotia	Nasce próximo ao Campestre da Faxina, e possui confluência com o Rio Conchal. Sua foz está localizada no Rio Iguaçu
Rio da Várzea	Divisa de São José dos Pinhais com Tijucas do Sul
Rio de Uma	Nasce na região do Morro Redondo. Limite com Tijucas do Sul.
Rio Despique	Nascente na região do Marcelino, passa por Agaraú, Cotia, Cachoeira e deságua no Rio Iguaçu
Rio Iguaçu	Divisa com Fazenda Rio Grande e São José dos Pinhais
Rio Itaqui	Divisa de São José dos Pinhais com Piraquara
Rio Maciel	Importante afluente do Rio Pequeno
Rio Miringuava	É o maior rio sãojoseense. Sua nascente está localizada na Serra do Mar, com sua foz no Rio Iguaçu. Seus principais afluentes são Rio Arujá e Miringuava Mirim
Rio Pequeno	Nascente localizada próximo a Serra do Mar, é afluente do Rio Iguaçu
Rio Ressaca	Sua nascente principal está localizada no bairro Costeira, em propriedade particular. Deságua no Canal Extravasor do Rio Iguaçu
Rio São João	Sua nascente está localizada na Serra do Mar, com foz na bacia litorânea, é um dos formadores do Rio Cubatão, e é divisa do município com Guaratuba